Баргути е най-високопоставеният член на палестинското ръководство. Той бе арестуван през април, миналата година по време на операция “Защитна стена” в Рамала.
Израел го обвинява за връзки с екстремистката грпировка Танзим и му приписва организацията на 37 терористични акта, при които са загинали 26 израелци.
Израелските специални служби твърдят, че от килията си Баргути продлъжава да се занимава с терористична дейност.
По техни данни негов съмишлени тайно му е предал мобилен телефон в затвора, откъдето Марван Баргути е продължил с издаването на указания и заповеди за действия за извършването на терористичните атаки. Освен това лидерът на Фатах е в телефонна връзка и с новия палестински премиер Махмуд Абас.
Самият Баргути не признава обвиненията в терористична дейност, като подчертава, че е член на палестинския парламент. Той е бил един обявяван като за евентуален приемник на Ясер Арафат.
В самото начало на интифандата Баргути е бил главен координатор на всички палестински военни групировки на Западния бряг, включително Танзим, Народен фронт за освобождение на Палестина, Хамас, Ислямски джихад.